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【佳學基因檢測】如何基于藥物遺傳學進行用藥指導基因檢測?

【佳學基因檢測】如何基于藥物遺傳學進行用藥指導基因檢測? 本期 CPT 刊登了一篇廣泛的文獻綜述,探討了 受體阻滯劑反應與與六個多態(tài)性基因相關的遺傳變異之間的關系,最終形成了一份

佳學基因檢測】如何基于藥物遺傳學進行用藥指導基因檢測?


藥物基因組學處快步發(fā)展階段。目前,我們對藥物基因組學相關的遺傳基礎的了解已經(jīng)增加了數(shù)千倍。許多罕見疾病是由調節(jié)基因區(qū)域的突變引起的,最近的證據(jù)表明,臨床上重要的 CYP 的重要 SNP 依賴性調節(jié)的很大一部分位于距離基因 1 Mb 以內。這表明,這些信息可以增強藥物基因組學預測的臨床適用性。

腫瘤學領域,我們對具有臨床意義的藥物基因組學應用預測藥物反應的了解更為深入。然而,在心血管疾病等其他領域,基因-藥物對氯吡格雷-CYP2C19 是少數(shù)具有一定臨床效用的藥物之一,盡管這種效用有限。
在 Duarte 等人的研究中,作者對CYP2D6、ADRB1、ADRB2、ADRA2C、GRK4 和 GRK5基因變異分布與 β 受體阻滯劑暴露和反應之間的關系進行了全面且高質量的文獻調查。他們的調查發(fā)現(xiàn),使用美托洛爾治療后,CYP2D6-PM 患者的心率下降比 CYP2D6-NM 患者多 3-8 次/分鐘,而使用卡維地洛、普萘洛爾、拉貝洛爾和奈必洛爾等其他 β 受體阻滯劑治療后未觀察到與 CYP2D6 相關的顯著影響。在此基礎上,作者提供了廣泛的指南,其中包含有關基因預測的 CYP2D6 代謝者狀態(tài)和美托洛爾治療的治療建議。

這就引發(fā)了人們對藥物基因組學指南對臨床實踐和美托洛爾治療的成本效益影響的質疑。藥物基因組學的價值在于識別相關的基因-藥物對,其中遺傳變異會導致藥物反應和副作用的臨床顯著的個體間差異。當這些對在臨床上適用并且對患者有益時,監(jiān)管指南對于協(xié)助醫(yī)療保健提供者至關重要。然而,在β受體阻滯劑作用的情況下,這種關系幾乎不存在,使得監(jiān)管指南的重要性降低。觀察到的對心率的影響(每分鐘減少 3-8 次)并不能證明預先進行基因檢測是合理的。因此,一般來說,只有當文獻中積累的證據(jù)與臨床實踐足夠相關并包含需要實施的明確建議時,才會發(fā)布指南。

傳播沒有重大臨床應用的指南實際上可能會導致臨床醫(yī)生對在醫(yī)療保健中使用藥物基因組學的關注度降低。醫(yī)療保健提供者可能會認為此類指南是一種行政負擔,這會降低他們對其他治療領域的藥物基因組學信息的興趣。因此,有必要根據(jù)臨床情況調整指南的內容,并僅關注與臨床使用高度相關的內容。

藥物基因組學建議的臨床影響

藥物基因組學建議包含在產(chǎn)品說明(例如藥品標簽或產(chǎn)品特性摘要 (SmPC))中。這些建議由美國食品藥品管理局 (FDA) 和歐洲藥品管理局 (EMA) 等監(jiān)管機構提出。此外,臨床藥物基因組學實施聯(lián)盟 (CPIC) 和荷蘭藥物基因組學工作組 (DPWG) 等學術組織基于相關專家的大量努力和知識,為使用受基因變異影響的藥物提供了非常高質量的指南。在 2020 年發(fā)布的一項比較中,我們發(fā)現(xiàn)了 FDA 和包括 EMA 在內的各歐洲當局以及基因研究中心藥物評估委員會 (CBG-MEB) 和德國聯(lián)邦藥品和醫(yī)療器械研究所 (FIDMD) 對 1995 年 EMA 成立之前批準的藥物的藥物基因組學指南(統(tǒng)稱為 EMA/FM),存在明顯的差異。Koutsilieri 等人也發(fā)表了指南數(shù)據(jù)中類似的異質性。

我們檢查了 CPIC、DPWG、FDA 和 EMA/FM 提供的 505 種不同藥物的藥物基因組學標簽信息。根據(jù)CPIC 和 DPWG 指南,在 54 種具有可采取行動的基因-藥物相互作用的藥物中,只有 50% 的相應 SmPC 或藥物標簽包含可采取行動的藥物基因組學信息。在這 54 種藥物中,只有 10 種(18%)的 FDA、EMA/FM、CPIC 和 DPWG 建議一致。此外,我們還檢查了另外 450 種沒有 CPIC 或 DPWG 建議的藥物,并確定了 126 種根據(jù) FDA 和/或 EMA/FM 具有可采取行動的基因標簽的藥物。對于這 126 種藥物和 54 種原始藥物,F(xiàn)DA 和 EMA/FM 在可用藥物基因組學標簽方面的一致性僅為 54%。

這些差異削弱了藥物基因組學咨詢的臨床重要性。這主要是因為許多已發(fā)表研究的科學和臨床基礎薄弱。這些問題可能與以下方面有關:(i)研究力度不足,(ii)所研究的藥物-基因對的選擇不相關,(iii)開放標簽臨床試驗導致顯著的安慰劑效應,(iv)疾病分類不均一,以及(v)研究數(shù)量不足。因此,提出的許多結論無法重現(xiàn)。此外,該領域的許多薈萃分析在以下方面不夠均一:(i)藥物濃度,(ii)藥物選擇,(iii)治療時機,以及(iv)初始病理生理學定義。顯然,更有意義和分層的臨床試驗應該促使當局達成更大的共識,這將大大改善藥物基因組學藥物標簽在臨床實踐中的實施。

使用特定的基因-藥物對預測基因變異在藥物反應中的作用

佳學基因認為,只有當基因-藥物對定義明確,且已知治療濃度下的基因變異效應具有臨床相關性時,才應使用預測性藥物基因組學。在這方面,F(xiàn)DA 有一個有趣的網(wǎng)站,其中列出了與 (i) 治療管理建議、(ii) 對安全性或反應的影響以及 (iii) 對藥代動力學特性的影響相關的藥物基因組學關聯(lián)的基因-藥物對。FDA 提供的這些藥物基因組學關聯(lián)與代謝藥物的酶的基因變體、基因轉運體以及與某些不良事件易感性相關的基因變體有關。有趣的是,第 1 組 124 種藥物基因組生物標志物中有 70% 僅與CYP2C9、CYP2C19或CYP2D6基因的遺傳變異有關,63% 的生物標志物與中樞神經(jīng)系統(tǒng)或腫瘤治療領域有關,只有普羅帕酮和華法林與心血管領域有關。FDA 批準的美托洛爾標簽不包含任何有關藥物基因組學的建議。

藥物基因組生物標志物進一步轉化為臨床應用

將藥物基因組生物標志物更好地整合到各個醫(yī)療服務提供者的臨床工作中具有重要意義。與在常規(guī)臨床工作中有限使用藥物基因組標志物相關的關鍵問題包括:

  • 缺乏臨床益處的證據(jù);
  • 臨床醫(yī)生的認識和培訓有限;
  • 藥物基因組學信息的復雜性和解釋;
  • 臨床醫(yī)生的時間壓力;
  • 藥物基因組學測試的可用性和成本;以及
  • 電子健康記錄(EHR)中藥物基因組學數(shù)據(jù)的有限實施。

對于藥物基因組學領域的科學家來說,很明顯,在大多數(shù)歐洲和美國國家,藥物基因組學信息在常規(guī)臨床實踐中的應用還不夠發(fā)達或利用不足。未來,針對常規(guī)護理中的臨床醫(yī)生制定清晰、簡明的指南將改善實施情況。在這種情況下,重要的是將這些指南限制在與影響藥物反應和不良事件的個體間差異的其他因素相比,遺傳因素確實很重要的情況,即僅關注導致 PM 或 UM 表型的相關遺傳變異(見圖1 ) 。

詳細信息請參閱圖片下方的說明

圖 1:遺傳和偏見因??素對于解釋臨床觀察到的藥物反應和副作用的個體間差異非常重要。對于大多數(shù)藥物而言,遺傳對這些差異的貢獻相對較小,為了確定實際的遺傳效應,必須考慮所有列出的偏見因素,例如藥物間相互作用 (DDI)。該圖說明了文獻中描述了遺傳因素和反應之間關聯(lián)的藥物情況。不同偏見因素的相對重要性是作者的估計。需要強調的是,需要針對醫(yī)療保健提供者的指南,其中僅根據(jù)藥物基因組學分析揭示的患者不同的弱代謝者 (PM) 或超快代謝者 (UM) 表型討論最明顯和臨床相關的病例。

已經(jīng)制定的許多藥物基因組學指南非常廣泛,長達數(shù)頁。它們主要針對該領域的專業(yè)人士,其中許多人是生物技術行業(yè)的利益相關者。然而,如上所述,缺乏具有純臨床特征的指南,涵蓋不同治療領域藥物基因組學的最重要部分??梢哉f,制定需要大量工作且側重于臨床相關性有限或沒有臨床相關性的藥物治療的指南是浪費時間。然而,未來與不同治療領域的醫(yī)生密切合作制定并定期更新的有針對性的指南將有利于藥物基因組學在醫(yī)療保健中的實施,并帶來更具成本效益和更個性化的藥物治療。

 

(責任編輯:佳學基因)
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