【佳學基因檢測】腎病綜合征基因檢測的科學進展與臨床意義
一、腎病綜合征概述
腎病綜合征(Nephrotic Syndrome, NS)是一組臨床癥狀群,包括大量蛋白尿、水腫、低白蛋白血癥和高脂血癥。此病癥可由多種病因引起,其中遺傳因素在一些患者的發(fā)病機制中發(fā)揮了重要作用。近年來,基因檢測技術的發(fā)展為腎病綜合征的診斷和治療帶來了新的視角,尤其是在識別遺傳變異方面。
二、遺傳因素在腎病綜合征中的作用
腎病綜合征的致病基因鑒定基因解碼顯示,超過70個基因與該疾病相關。大多數(shù)這些基因以常染色體隱性遺傳(Autosomal Recessive, AR)方式遺傳。這意味著,只有在個體同時攜帶兩個致病基因變異時,才會表現(xiàn)出疾病的癥狀。而在基因檢測中,發(fā)現(xiàn)的某些變異可能是異合致病性變異(Heterozygous Predicted-Pathogenic Variants,HPPVs)),這些變異在單拷貝時并不一定導致疾病,但在兩個拷貝存在時可能會引發(fā)疾病。
三、基因檢測中的挑戰(zhàn)
在腎病綜合征的基因檢測中,識別復合雜合致病性變異(HPPVs)可能面臨以下挑戰(zhàn):
-
變異的真實意義:復合雜合致病性變異(HPPVs)在異合狀態(tài)下的致病性難以確定,尤其是這些變異是否具有真正的病理意義,還是偶然發(fā)現(xiàn)的無關變異,這對于臨床診斷至關重要。
-
是否遺漏了第二個致病變異:檢測中可能未發(fā)現(xiàn)的第二個致病變異可能會掩蓋實際的病因,影響最終的診斷。
四、研究方法與數(shù)據(jù)分析
為了提高對復合雜合致病性變異(HPPVs)的理解,腎病綜合征致病基因鑒定基因解碼的研究團隊對187名來自英國稀有疾病登記庫的類固醇抵抗性腎病綜合征(Steroid-Resistant Nephrotic Syndrome, SRNS)兒科患者進行了外顯子組測序(Exome Sequencing)。這些患者來自Evelina兒童醫(yī)院及倫敦的其他診所。
在分析過程中,腎病綜合征致病基因鑒定基因解碼對59個與AR足細胞病相關的基因進行了篩查,生成了復合雜合致病性變異(HPPVs)的列表。然后,將這些復合雜合致病性變異(HPPVs)的頻率與來自gnomAD數(shù)據(jù)庫的‘對照’人群進行了比較。gnomAD數(shù)據(jù)庫包含約50,000名個體的外顯子組數(shù)據(jù),用于比較患者和對照人群中變異的頻率。
腎病綜合征致病基因鑒定基因解碼使用了定制的過濾過程來預測變異的‘可能致病性’,最終識別出130名白種人SRNS患者中有201個罕見的異合變異,其中17個(8.5%)被標記為‘可能致病’(復合雜合致病性變異(HPPVs))。
五、結(jié)果分析
1. 復合雜合致病性變異(HPPVs)頻率比較
在對比SRNS患者與對照人群時,腎病綜合征致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn),在57個基因中,復合雜合致病性變異(HPPVs)的頻率在患者和對照組之間沒有顯著差異。特別是在ARHGDIA和TP53RK基因中,僅在‘高嚴格性’過濾設置下,控制組中復合雜合致病性變異(HPPVs)的數(shù)量顯著高于患者組。
在沒有確診遺傳學診斷的SRNS患者中,所有基因的復合雜合致病性變異(HPPVs)頻率也沒有表現(xiàn)出統(tǒng)計學顯著差異。
2. 臨床意義
研究結(jié)果表明,在大多數(shù)AR足細胞病相關基因中,復合雜合致病性變異(HPPVs)的頻率在SRNS患者與對照人群中相似。因此,復合雜合致病性變異(HPPVs)的發(fā)現(xiàn)不一定代表其致病性。盡管這些變異可能與腎病綜合征相關,但在臨床應用中,復合雜合致病性變異(HPPVs)不一定是疾病的直接原因。
六、臨床應用與建議
根據(jù)上述研究結(jié)果,腎病綜合征致病基因鑒定基因解碼提出以下建議:
-
解讀復合雜合致病性變異(HPPVs)需謹慎:在臨床實踐中,發(fā)現(xiàn)復合雜合致病性變異(HPPVs)并不等同于確診腎病綜合征。應結(jié)合患者的臨床表現(xiàn)、家族史及其他檢測結(jié)果綜合考慮。
-
考慮其他致病變異:在發(fā)現(xiàn)復合雜合致病性變異(HPPVs)的情況下,應考慮是否可能存在未被檢測到的第二個致病變異,這可能需要進一步的基因組分析或家系研究來確認。
-
個體化解讀:每個基因檢測結(jié)果都需根據(jù)具體臨床背景進行解讀。盡管復合雜合致病性變異(HPPVs)在SRNS患者中的頻率與對照人群相似,但這并不排除其在某些個體中的致病可能性。
-
研究與監(jiān)測:持續(xù)的研究和改進基因檢測技術將有助于更準確地識別腎病綜合征的遺傳因素,并為患者提供更有效的治療策略。
七、腎病綜合征基因檢測共識
腎病綜合征的基因檢測為理解疾病的遺傳機制提供了重要信息。然而,復合雜合致病性變異(HPPVs)的存在不一定代表致病性,尤其是在常染色體隱性遺傳基因中。因此,在解釋這些變異時,需要綜合考慮臨床背景和其他可能的致病因素。未來,隨著技術的進步和研究的深入,腎病綜合征致病基因鑒定基因解碼有望獲得更清晰的遺傳信息,從而改善腎病綜合征的診斷和治療。
(責任編輯:佳學基因)