【佳學基因檢測】先天性糖基化障礙Iip型基因檢測:基因數(shù)量及基因位點的更新
先天性糖基化障礙Iip型基因檢測:基因數(shù)量及基因位點的更新
先天性糖基化障礙(Congenital Disorders of Glycosylation, CDG)是一類由糖基化過程異常引起的遺傳性疾病。這些疾病通常是由于特定基因突變導致糖基化酶或相關酶的功能缺陷,從而影響糖基化的正常過程。
對于I型(又稱CDG-I型)糖基化障礙的基因檢測,主要涉及以下幾類基因:
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PMM2基因:編碼磷酸甘露糖異構(gòu)酶2,這是最常見的CDG-I型的相關基因,突變會導致PMM2-CDG(也稱為CDG-Ia)。
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MPI基因:編碼麥芽糖異構(gòu)酶,這個基因突變會導致MPI-CDG(也稱為CDG-Ib)。
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ALG3基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Ic的相關基因。
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ALG6基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Id的相關基因。
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ALG8基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Ie的相關基因。
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ALG12基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Ig的相關基因。
隨著基因組學和臨床研究的不斷進展,對這些基因的了解也在不斷更新。新的基因突變和基因變異可能會被發(fā)現(xiàn),并被納入到基因檢測的范圍中。此外,一些基因的突變可能會影響糖基化途徑的不同環(huán)節(jié),導致不同類型的CDG-I型疾病。
如果你需要最新的基因數(shù)量和基因位點的詳細信息,可以查閱《人體基因序列變化懷疾病表征數(shù)據(jù)庫》,也可以查閱如OMIM(在線孟德爾遺傳疾病數(shù)據(jù)庫)、ClinVar(臨床變異數(shù)據(jù)庫)等。這些資源會提供有關各個基因及其突變的最新信息,并反映基因檢測的最新進展。
先天性糖基化障礙Iip型(Congenital Disorder of Glycosylation, Type Iip)的致病基因鑒定采用什么基因檢測方法?
先天性糖基化障礙Iip型的致病基因鑒定通常采用全外顯子測序(whole exome sequencing)或全基因組測序(whole genome sequencing)等高通量測序技術進行基因檢測。這些技術可以幫助鑒定患者的基因突變或變異,從而確定疾病的致病基因。
先天性糖基化障礙Iip型(Congenital Disorder of Glycosylation, Type Iip)的致病基因鑒定采用全外顯子測序加上基因解碼的優(yōu)勢?
先天性糖基化障礙Iip型是一種罕見的遺傳性疾病,其致病基因可能存在于任何一個基因中。因此,全外顯子測序可以同時檢測所有基因的變異,有助于快速準確地確定患者的致病基因。此外,基因解碼可以幫助研究人員理解這些基因的功能和與疾病發(fā)病機制之間的關系,為未來的治療和預防提供重要的參考。因此,全外顯子測序加上基因解碼的方法在先天性糖基化障礙Iip型的致病基因鑒定中具有重要的優(yōu)勢。
先天性糖基化障礙Iip型概述
先天性糖基化障礙IIp型(CDG2P)是一種常染色體隱性遺傳代謝疾病,主要表現(xiàn)為輕度的肝功能異常,通常在青春期通過常規(guī)檢查偶然發(fā)現(xiàn)。實驗室檢查常見異常包括肝酶和堿性磷酸酶水平升高、凝血因子缺乏、高膽固醇血癥以及低銅藍蛋白。血清等電聚焦分析顯示N-和O-糖基化同時存在缺陷,提示可能是高爾基體功能缺陷(Jansen等,2016年總結(jié))。
先天性糖基化障礙Iip型臨床特征
Jansen等(2016年)報告了來自3個無關家庭的4例患者,這些患者的主要特征是輕度代謝障礙,主要影響肝臟。其中三名患者(包括兩名出生于近親希臘家庭的兄弟姐妹)在青春期的常規(guī)血液檢查中發(fā)現(xiàn)肝酶升高。三名患者的精神運動發(fā)育正常。其他實驗室異常包括低銅藍蛋白、高膽固醇血癥、堿性磷酸酶升高和凝血因子減少。肝臟影像學檢查或活檢顯示脂肪變性。這些實驗室異常在某些患者中會波動或隨年齡改善。41歲時的一名患者肝臟活檢顯示輕度纖維化、肝細胞空泡變性、高爾基體和/或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)擴張及囊泡形成,以及線粒體異常,如線粒體脊柱斷裂和內(nèi)基質(zhì)改變(Calvo等,2008年)。第四名患者是一名23歲的希臘女性,早期兒童期被發(fā)現(xiàn)有肌張力低下和精神運動障礙,后來發(fā)現(xiàn)肝酶和堿性磷酸酶升高、高膽固醇血癥和低銅藍蛋白,但未能進行后續(xù)跟蹤。這些患者的血清轉(zhuǎn)鐵蛋白等電聚焦(IEF)顯示2型模式,提示N-糖基化異常,同時ApoC-III的IEF異常提示O-糖基化異常。
先天性糖基化障礙Iip型遺傳方式
Jansen等(2016年)報告的CDG2P家系的遺傳模式與常染色體隱性遺傳一致。
先天性糖基化障礙Iip型分子遺傳學
Jansen等(2016年)在來自3個無關家庭的4例CDG2P患者中,發(fā)現(xiàn)了TMEM199基因(616815)中的純合突變或復合雜合突變。前兩個家系的突變通過全外顯子組測序發(fā)現(xiàn),所有突變都與該疾病在家系中的遺傳模式一致。通過質(zhì)譜分析檢測一名患者的轉(zhuǎn)鐵蛋白和總血漿N-糖基,發(fā)現(xiàn)與對照組相比,糖基合成不完全,缺乏半乳糖和唾液酸?;颊叩某衫w維細胞顯示與對照組相比,高爾基體蛋白糖基化處理的普遍缺陷,并且該缺陷在轉(zhuǎn)導了野生型TMEM199后得到恢復。兩家族患者細胞的Western blot分析顯示TMEM199蛋白水平降低,但未對變異體進行直接功能研究。