【佳學(xué)基因檢測(cè)】肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療?
更先進(jìn)的肺癌基因檢測(cè)使更多的受檢者有了靶向藥物:
《肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》概述包括對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組最顯著的分子改變的總結(jié)和分析?!斗伟┗驒z測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》將討論新一代測(cè)序 (NGS) 在肺癌領(lǐng)域日益廣泛的應(yīng)用所帶來(lái)的診斷與治療的改變,并探討腫瘤間異質(zhì)性、腫瘤內(nèi)異質(zhì)性、腫瘤突變負(fù)擔(dān)和液體活檢的出現(xiàn)等如何通過(guò)肺癌基因檢測(cè)被揭示出來(lái),從而指導(dǎo)精準(zhǔn)分型和靶向藥物治療。此外,《肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》還介紹了不斷發(fā)展的分子病理學(xué)領(lǐng)域如何加深對(duì)非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC) 不同組織學(xué)表型和小細(xì)胞肺癌潛在生物學(xué)的理解?!斗伟┗驒z測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》將介紹分子病理學(xué)領(lǐng)域正在進(jìn)行的科學(xué)發(fā)現(xiàn)和技術(shù)進(jìn)步對(duì)于生物標(biāo)志物、治療劑、臨床試驗(yàn)的開(kāi)發(fā)以及最終改善患者護(hù)理的重要性。
《肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》的目的是重點(diǎn)回顧胸部分子病理學(xué)中臨床最相關(guān)的方面。從歷史上看,被認(rèn)為是肺癌驅(qū)動(dòng)因素的基因組變異 (GA) 是通過(guò)采用桑格測(cè)序、焦磷酸測(cè)序、免疫組織化學(xué) (IHC) 和熒光原位雜交 (FISH) 等基因檢測(cè)技術(shù)按照受檢者或者臨床大夫的需求進(jìn)行檢測(cè)的,這樣的檢測(cè)結(jié)果只能將基因組變異 (GA) 限制在選定的基因上。表皮生長(zhǎng)因子受體 ( EGFR ) 的突變以及間變性淋巴瘤激酶 ( ALK ) 基因和ROS1基因的易位是前三種被確認(rèn)為可采取臨床行動(dòng)的驅(qū)動(dòng)因素的變異,并且占肺癌初始臨床基因檢測(cè)的大多數(shù)。
隨著新一代測(cè)序 (NGS) 的使用變得更具成本效益和廣泛應(yīng)用,它揭示了更多可指導(dǎo)靶向藥物選擇的基因組變異 (GA) 。越來(lái)越多的證據(jù)表明,NGS 是一種精確的技術(shù),其性能與傳統(tǒng)方法一致或更好。全面基因組分析 (CGP) 提供的可指導(dǎo)靶向藥物選擇基因組變異 (GA) 信息的發(fā)展推動(dòng)了精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展,旨在為靶向治療提供基于證據(jù)的基因組變異 (GA) 解釋。
NGS 覆蓋的基因和基因組變異 (GA) 數(shù)量增加,擴(kuò)大了肺癌中可指導(dǎo)靶向藥物選擇的基因組變異 (GA) 種類。晚期肺癌患者轉(zhuǎn)向基于 NGS 的檢測(cè),減少了未確定驅(qū)動(dòng)因素的肺癌病例數(shù)量。越來(lái)越多的病例報(bào)告描述了通過(guò) NGS 確定的新驅(qū)動(dòng)因素患者,如果僅通過(guò)基于熱點(diǎn)的面板進(jìn)行評(píng)估,則無(wú)法發(fā)現(xiàn)這些驅(qū)動(dòng)因素,這是眾多基因檢測(cè)無(wú)法找到藥物的原因。
在過(guò)去,病理學(xué)家通過(guò)審查蘇木精和伊紅 (H&E) 染色的切片將肺癌分為非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC) (∼85%) 和小細(xì)胞肺癌 (SCLC) (∼15%)。非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC) 是一類異質(zhì)性實(shí)體,包括肺腺癌 (LUAD) 等最常見(jiàn)的組織學(xué)癌癥類型(約 50%)、肺鱗狀細(xì)胞癌 (SqCCL) 等第二常見(jiàn)類型(約 30%)、大細(xì)胞肺癌 (LCLC)(約 10%)以及多種組織學(xué)表型的組合,例如腺鱗癌 (ASC),以及罕見(jiàn)的組織學(xué)實(shí)體,例如非典型類癌 (AC)、支氣管腺癌和肉瘤樣癌,這些共同構(gòu)成了其余類型的 NSCLC(約 10%)。
在臨床實(shí)踐中,肺癌患者通常會(huì)接受初步活檢,以確定 H&E 上是否存在能夠診斷區(qū)分 NSCLC 或 SCLC 的組織形態(tài)學(xué)特征。IHC 的表現(xiàn)通常有助于確定 NSCLC 的亞型。有利于 LUAD 的 NSCLC 的 IHC 通常對(duì) CK7 和 TTF-1 呈陽(yáng)性,對(duì) p63、CK5/6 和 p40 呈陰性。有利于 SqCCL 的 NSCLC 的 IHC 通常對(duì) p63、CK5/6 和 p40 呈陽(yáng)性,對(duì) TTF-1 和 CK7 呈陰性。確立診斷的技巧可能具有挑戰(zhàn)性,因?yàn)樵S多病理學(xué)家都知道,在實(shí)踐中,一些腫瘤可能沒(méi)有“讀過(guò)”有關(guān)傳統(tǒng) IHC 染色模式的書(shū)。在這種情況下,其他特殊染色(如粘蛋白)可以提供幫助(例如,粘蛋白通常對(duì) LUAD 呈陽(yáng)性,對(duì) SqCCL 呈陰性)。 ASC 是一種罕見(jiàn)的雙相腫瘤,這意味著它有一個(gè) LUAD 成分和一個(gè) SqCCL 成分。根據(jù)定義,這些成分至少有 10% 的惡性鱗狀和腺狀成分。神經(jīng)內(nèi)分泌 IHC 標(biāo)記物(CD56、嗜鉻粒蛋白和突觸素)通常對(duì)神經(jīng)內(nèi)分泌癌(例如 SCLC 和 LCLC)呈陽(yáng)性。在 NSCLC 中,由 IHC(例如 PD-L1 IHC 22C3 pharmDx)確定的程序性死亡配體 1 (PD-L1) 的腫瘤比例評(píng)分 (TPS) 有助于確定是否適合接受免疫療法。在將組織提交進(jìn)行 NGS 時(shí),可通過(guò)焦磷酸測(cè)序等快速方法選擇性地快速檢測(cè)EGFR、KRAS和BRAF中的突變,而ALK和ROS1中的重排可通過(guò) FISH 快速識(shí)別。當(dāng) NGS 結(jié)果可用時(shí),這些結(jié)果可以證實(shí)快速測(cè)試的結(jié)果,并可能提供可作為可指導(dǎo)靶向藥物選擇目標(biāo)的其他基因組變異 (GA) 。
醫(yī)療保險(xiǎn)和醫(yī)療補(bǔ)助服務(wù)中心 (CMS) 通過(guò) 1988 年臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)修正案 (CLIA) 認(rèn)證流程對(duì)所有實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)進(jìn)行監(jiān)管。開(kāi)發(fā)分子組以獲取分析結(jié)果來(lái)指導(dǎo)患者護(hù)理的商業(yè)實(shí)驗(yàn)室和領(lǐng)先癌癥中心必須擁有獲得醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)室認(rèn)證的實(shí)驗(yàn)室。例如,PD-L1 IHC 22C3 pharmDx 檢測(cè)已獲得 FDA 批準(zhǔn),用于識(shí)別符合使用派姆單抗治療條件 (TPS ≥ 1%) 的 NSCLC 患者,該檢測(cè)可在 NeoGenomics Laboratories 獲得,已獲得 CLIA 認(rèn)證。
特別是在肺活檢中,需要在獲取足夠組織用于 H&E、IHC、快速檢測(cè)和/或 NGS 的需求與降低醫(yī)源性氣胸等不良事件的風(fēng)險(xiǎn)之間取得平衡。臨床醫(yī)生和患者之間必須進(jìn)行討論,以溝通風(fēng)險(xiǎn)與活檢獲得的診斷益處之間的平衡,以確定患者明確表示同意接受手術(shù)以獲取組織用于診斷目的。
鑒于目前描述肺癌分子病理學(xué)的文獻(xiàn)數(shù)量龐大、范圍廣泛且發(fā)展迅速,《肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》旨在僅提煉出最突出的觀點(diǎn),以對(duì)其他文章中沒(méi)有介紹的內(nèi)容進(jìn)行補(bǔ)充。關(guān)于我們對(duì)肺分子病理學(xué)的理解,一個(gè)普遍的警告是,一些研究在分子上表征 NSCLC 而不區(qū)分組織學(xué)類型,這使得不同肺癌亞型之間的明確分子區(qū)別變得復(fù)雜。
在此,《肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療》描述了不同組織學(xué)類型肺癌之間的基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)差異,并探討了其與研究和治療策略的關(guān)系。
肺癌基因檢測(cè)如何有助于更好的診斷和治療?
肺癌是全球最常見(jiàn)的癌癥之一,其高發(fā)病率和致死率使得其早期診斷和個(gè)體化治療成為醫(yī)學(xué)研究的重點(diǎn)。近年來(lái),基因檢測(cè)技術(shù)的迅猛發(fā)展為肺癌的診斷和治療提供了新的視角和方法。本文將探討肺癌基因檢測(cè)如何在提高診斷準(zhǔn)確性、制定個(gè)體化治療方案以及預(yù)測(cè)預(yù)后等方面發(fā)揮關(guān)鍵作用。
1. 提高肺癌的診斷準(zhǔn)確性
肺癌的早期癥狀往往不明顯,常常在疾病晚期才被發(fā)現(xiàn)。傳統(tǒng)的診斷方法,如胸部X光檢查和CT掃描,雖然在發(fā)現(xiàn)腫瘤方面有一定的效果,但對(duì)早期微小病變的檢測(cè)能力有限?;驒z測(cè)技術(shù)的引入,為肺癌的早期診斷提供了更為敏感和特異的方法。
基因檢測(cè)可以通過(guò)分析患者血液中的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)或組織樣本中的基因突變,幫助檢測(cè)早期肺癌。特別是在肺癌患者中,一些基因突變?nèi)鏓GFR、KRAS和ALK等的存在與肺癌的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)。通過(guò)檢測(cè)這些基因突變,醫(yī)生可以更早地發(fā)現(xiàn)肺癌,并進(jìn)行早期干預(yù)。此外,基因檢測(cè)還可以幫助識(shí)別出高風(fēng)險(xiǎn)人群,進(jìn)行定期篩查,從而在病程初期及時(shí)發(fā)現(xiàn)癌癥。
2. 個(gè)體化治療方案的制定
肺癌的治療方案通常依賴于癌癥的分期、組織學(xué)類型以及患者的整體健康狀況。傳統(tǒng)的治療方法如手術(shù)、放療和化療雖然有效,但往往存在副作用和療效不佳的情況?;驒z測(cè)的出現(xiàn),使得個(gè)體化治療成為可能。通過(guò)對(duì)患者癌癥組織的基因組進(jìn)行全面分析,可以識(shí)別出特定的突變和基因異常,從而制定針對(duì)性的治療方案。
靶向治療是基因檢測(cè)在肺癌治療中的一個(gè)重要應(yīng)用。靶向藥物能夠特異性地針對(duì)癌細(xì)胞中的特定基因突變或異常信號(hào)通路,從而有效抑制腫瘤生長(zhǎng)。例如,對(duì)于EGFR突變陽(yáng)性的非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者,醫(yī)生可以使用EGFR酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)如厄洛替尼或吉非替尼,這些藥物可以顯著提高治療效果并減少副作用。類似地,對(duì)于ALK基因重排的肺癌患者,可以使用ALK抑制劑如克唑替尼,這種藥物能夠有效靶向并抑制ALK蛋白,從而控制腫瘤的進(jìn)展。
免疫檢查點(diǎn)抑制劑是另一種基因檢測(cè)推動(dòng)的創(chuàng)新治療方法。免疫檢查點(diǎn)抑制劑通過(guò)阻斷腫瘤細(xì)胞逃避免疫系統(tǒng)的機(jī)制,增強(qiáng)機(jī)體對(duì)腫瘤的免疫應(yīng)答?;驒z測(cè)可以幫助識(shí)別適合免疫治療的患者。例如,腫瘤微環(huán)境中的PD-L1表達(dá)水平和腫瘤突變負(fù)荷(TMB)可以作為免疫治療的預(yù)測(cè)標(biāo)志物,幫助醫(yī)生選擇適合的免疫檢查點(diǎn)抑制劑。
3. 預(yù)測(cè)預(yù)后的能力
除了在診斷和治療中的應(yīng)用,基因檢測(cè)還能夠?yàn)榉伟┗颊叩念A(yù)后提供重要信息。不同的基因突變和基因表達(dá)模式可以反映癌癥的侵襲性、轉(zhuǎn)移潛力和對(duì)治療的反應(yīng)。例如,某些基因突變?nèi)?a href='http://m.npz842.cn/tk/jiema/cexujishu/2023/38566.html' target='_blank'>TP53和KRAS的存在與腫瘤的侵襲性和轉(zhuǎn)移性相關(guān),這些信息有助于醫(yī)生預(yù)測(cè)患者的預(yù)后和制定后續(xù)治療方案。
預(yù)后分層是基因檢測(cè)在肺癌管理中的重要作用之一。通過(guò)分析腫瘤的基因組特征,醫(yī)生可以將患者分為高風(fēng)險(xiǎn)和低風(fēng)險(xiǎn)兩組,從而制定更為精準(zhǔn)的隨訪和治療計(jì)劃。例如,高突變負(fù)荷的患者可能需要更頻繁的監(jiān)測(cè)和更積極的治療,而低突變負(fù)荷的患者可能可以采取相對(duì)保守的治療方案。
4. 實(shí)際應(yīng)用和挑戰(zhàn)
盡管基因檢測(cè)在肺癌診斷和治療中具有顯著優(yōu)勢(shì),但在實(shí)際應(yīng)用中仍面臨一些挑戰(zhàn)。首先,基因檢測(cè)的成本較高,對(duì)于某些經(jīng)濟(jì)條件有限的患者來(lái)說(shuō),可能會(huì)成為障礙。其次,基因檢測(cè)結(jié)果的解讀需要專業(yè)的知識(shí)和經(jīng)驗(yàn),結(jié)果可能會(huì)受到各種因素的影響,因此需要結(jié)合臨床情況進(jìn)行綜合分析。此外,基因檢測(cè)技術(shù)的不斷發(fā)展和更新也要求醫(yī)療機(jī)構(gòu)保持技術(shù)的前沿性和準(zhǔn)確性。
綜上所述,肺癌基因檢測(cè)在提高診斷準(zhǔn)確性、制定個(gè)體化治療方案和預(yù)測(cè)預(yù)后方面發(fā)揮了重要作用。通過(guò)精準(zhǔn)的基因分析,醫(yī)生可以更早地發(fā)現(xiàn)肺癌,制定更為有效的治療方案,并對(duì)患者的預(yù)后進(jìn)行準(zhǔn)確預(yù)測(cè)。然而,要充分發(fā)揮基因檢測(cè)的優(yōu)勢(shì),仍需克服技術(shù)和經(jīng)濟(jì)上的挑戰(zhàn),并在臨床實(shí)踐中不斷優(yōu)化和應(yīng)用這些先進(jìn)的檢測(cè)技術(shù)。隨著科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,未來(lái)基因檢測(cè)將在肺癌的診斷和治療中發(fā)揮更大的作用,為更多患者帶來(lái)福音。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)